No Brasil Jonny Quest foi exibido pela primeira vez em 1966 quando passava na TV Globo do Rio de Janeiro. Era apresentado às 19 horas nos domingos, entre Disneylândia e o jornalístico Câmera Indiscreta.

Mais tarde, já na década de 1970, o desenho mudou para a TV Tupi e TVS/RJ. Por volta de 1985, foi para a TV Bandeirantes. Em 1994, Jonny Quest voltou a ser exibido no Brasil, com a estreia do canal pago Cartoon Network. A grande novidade era o fato dos desenhos irem ao ar com novas cópias remasterizadas e imagem limpa.

Na fase produzida nos anos 60, o desenho foi dublado pela Companhia Arte Industrial Cinematográfica – A.I.C./S. Paulo. Com as vozes de Rafael Cortez (Jonny Quest), Olney Cazarré (Hadji), Amaury Costa (Dr. Benton) e o conceituado ator e diretor de novelas da Globo, Dênis Carvalho (Bannon). 

Na fase seguinte do desenho, considerada uma segunda temporada, a dublagem foi realizada pela BKS com outro elenco de vozes. 

Uma nova versão do desenho chamada, As Incríveis Aventuras de Jonny Quest, foi produzida em 1996 e teve a dublagem da VTI.